Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf172C9J069 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf172C9J069 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf172C9J069 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms