Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
B4E1Z4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
B4E1Z4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
B4E1Z4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
B4E1Z4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
B4E1Z4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
B4E1Z4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
B4E1Z4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
B4E1Z4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
B4E1Z4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
B4E1Z4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
B4E1Z4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
B4E1Z4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
B4E1Z4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
B4E1Z4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
B4E1Z4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
B4E1Z4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
B4E1Z4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
B4E1Z4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
B4E1Z4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
B4E1Z4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
B4E1Z4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
B4E1Z4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
B4E1Z4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
B4E1Z4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
B4E1Z4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
B4E1Z4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
B4E1Z4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
B4E1Z4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
B4E1Z4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
B4E1Z4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
B4E1Z4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
B4E1Z4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
B4E1Z4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
B4E1Z4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
B4E1Z4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
B4E1Z4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
B4E1Z4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
B4E1Z4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
B4E1Z4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
B4E1Z4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
B4E1Z4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
B4E1Z4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
B4E1Z4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
B4E1Z4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
B4E1Z4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
B4E1Z4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
B4E1Z4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
B4E1Z4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
B4E1Z4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
B4E1Z4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
B4E1Z4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
B4E1Z4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
B4E1Z4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
B4E1Z4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
B4E1Z4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
B4E1Z4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
B4E1Z4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
B4E1Z4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
B4E1Z4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
B4E1Z4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
B4E1Z4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
B4E1Z4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
B4E1Z4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
B4E1Z4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
B4E1Z4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
B4E1Z4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
B4E1Z4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
B4E1Z4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
B4E1Z4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
B4E1Z4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
B4E1Z4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
B4E1Z4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
B4E1Z4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
B4E1Z4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
B4E1Z4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
B4E1Z4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
B4E1Z4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
B4E1Z4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
B4E1Z4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
B4E1Z4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
B4E1Z4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
B4E1Z4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
B4E1Z4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
B4E1Z4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
B4E1Z4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
B4E1Z4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
B4E1Z4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
B4E1Z4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
B4E1Z4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms