Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KDM4EB2RXH2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KDM4EB2RXH2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM4EB2RXH2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM4EB2RXH2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KDM4EB2RXH2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM4EB2RXH2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KDM4EB2RXH2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM4EB2RXH2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM4EB2RXH2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM4EB2RXH2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KDM4EB2RXH2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms