Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A8MVJ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A8MVJ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
A8MVJ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A8MVJ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A8MVJ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
A8MVJ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A8MVJ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A8MVJ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A8MVJ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A8MVJ9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A8MVJ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A8MVJ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A8MVJ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A8MVJ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
A8MVJ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A8MVJ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A8MVJ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A8MVJ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A8MVJ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A8MVJ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A8MVJ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A8MVJ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A8MVJ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A8MVJ9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A8MVJ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A8MVJ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A8MVJ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A8MVJ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A8MVJ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A8MVJ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A8MVJ9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A8MVJ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A8MVJ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A8MVJ9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A8MVJ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A8MVJ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A8MVJ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A8MVJ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A8MVJ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A8MVJ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A8MVJ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A8MVJ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A8MVJ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A8MVJ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A8MVJ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
A8MVJ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A8MVJ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A8MVJ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A8MVJ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A8MVJ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A8MVJ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A8MVJ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A8MVJ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
A8MVJ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A8MVJ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A8MVJ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A8MVJ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A8MVJ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A8MVJ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A8MVJ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A8MVJ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A8MVJ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A8MVJ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A8MVJ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A8MVJ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
A8MVJ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A8MVJ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A8MVJ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A8MVJ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A8MVJ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A8MVJ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A8MVJ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A8MVJ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A8MVJ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A8MVJ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A8MVJ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A8MVJ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A8MVJ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A8MVJ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms