Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CD8B2A6NJW9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD8B2A6NJW9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD8B2A6NJW9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms