Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC69A6NI79 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC69A6NI79 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC69A6NI79 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms