Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN8A6NHC0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN8A6NHC0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN8A6NHC0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN8A6NHC0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN8A6NHC0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN8A6NHC0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN8A6NHC0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN8A6NHC0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN8A6NHC0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN8A6NHC0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms