Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCHNA4D1U4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCHNA4D1U4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LCHNA4D1U4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCHNA4D1U4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms