Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPED1A4D0V7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPED1A4D0V7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPED1A4D0V7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms