Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC162PA2VCL2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC162PA2VCL2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC162PA2VCL2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms