Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SSC5DA1L4H1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSC5DA1L4H1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SSC5DA1L4H1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms