Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMEM30CPA0ZSE6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM30CPA0ZSE6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms