Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS05

TRBV5-7, T-cell receptor beta variable 5-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV5-7A0A0A0MS05 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV5-7A0A0A0MS05 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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