Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V9GY48 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V9GY48 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V9GY48 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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