Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms