Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFR3BQ9Y2G0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFR3BQ9Y2G0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFR3BQ9Y2G0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFR3BQ9Y2G0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFR3BQ9Y2G0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFR3BQ9Y2G0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFR3BQ9Y2G0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFR3BQ9Y2G0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms