Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms