Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAPPC2LQ9UL33 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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