Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms