Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPASTQ9UBP0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPASTQ9UBP0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms