Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms