Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CXXC1Q9P0U4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms