Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOMER3Q9NSC5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOMER3Q9NSC5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms