Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.9 ms