Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTRT3Q9BYD9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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