Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPS2Q9BXY5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms