Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms