Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP58Q9BVL2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP58Q9BVL2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms