Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CHCHD7Q9BUK0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms