Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms