Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KCNS3Q9BQ31 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms