Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPOCK3Q9BQ16 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms