Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2orf48Q96LS8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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