Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK5RAP3Q96JB5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms