Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms