Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BHMTQ93088 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms