Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPC24Q8NBT2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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