Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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RNF182Q8N6D2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RNF182Q8N6D2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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