Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VWA5B2Q8N398 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms