Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRP0

PRR23C, Proline-rich protein 23C, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23CQ6ZRP0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRR23CQ6ZRP0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms