Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRIG3Q6UXM1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms