Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CREB3L3Q68CJ9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms