Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KHDC1Q4VXA5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms