Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms