Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLA2G4EQ3MJ16 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.5 ms