Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
USF2Q15853 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
USF2Q15853 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
USF2Q15853 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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