Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PDK2Q15119 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PDK2Q15119 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms