Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX1Q14549 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GBX1Q14549 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms