Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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APOFQ13790 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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APOFQ13790 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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APOFQ13790 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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APOFQ13790 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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APOFQ13790 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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APOFQ13790 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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APOFQ13790 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
APOFQ13790 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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