Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PMS2P11Q13670 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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